November 8, 2024

Forschungszentrum Jülich

Jülich

Masterarbeit - Bioprozessoptimierung der heterologen Produktion von antimikrobiellen Proteinen

Unser Institutsbereich Biotechnologie (IBG-1) am Institut für Bio- und Geowissenschaften ist führend für Bioprozessentwicklung im Bereich Industrielle Biotechnologie. Unsere Arbeitsgruppe Bioprozesse und Bioanalytik hat große Kompetenzen im Bereich der mikrobiellen Bioprozessentwicklung und Stammkonstruktion mit Werkzeugen und Workflows zur Laborautomatisierung, Miniaturisierung und Digitalisierung. Hier wird an innovativen Ansätzen zur zielgerichteten Durchmusterung von Stammbibliotheken und der Bioprozessentwicklung geforscht. Antimikrobielle Peptide (AMP) haben in den letzten Jahren zunehmend an Bedeutung gewonnen. Sie werden von sogenannten mikrobiellen Starterkulturen hergestellt. Werden Sie Teil unseres Teams und leisten einen Beitrag für die Sicherheit von Lebensmitteln und werden auch für den Einsatz im medizinischen Bereich gegen antibiotikaresistente Humanpathogene diskutiert.

Ihre Aufgaben:
Die Gewinnung der antimikrobiellen Peptide kann mittels heterologer Produktion in dem industriellen Plattformorganismus Corynebacterium glutamicum über Proteinsekretion erfolgen. Ausgehend von bereits vorhandenen automatisierten Workflows zur Charakterisierung der Produktion von antimikrobiellen Peptiden soll mit ausgewählten Stämmen weitere Bioprozessoptimierung im Labormaßstab betrieben werden. Von Interesse sind dabei typische Bioprozessparameter und Einflussfaktoren, die die Konzentration, Ausbeute und Stabilität von antimikrobiellen Peptiden beeinflussen könnten. Im besonderen Fokus soll die Heterogenität des Bioreaktors in Bezug auf unterschiedliche Prozessparameter (C-Quelle, O2-Gehalt, p H-Wert) stehen, welche mittels einer Scale-Down Anlage untersucht werden soll.

Ihre Aufgaben im Detail:

Mikrobielle Kultivierung im Labormaßstab (DASGIP Parallel Bioreactor Systems)
Untersuchung von Reaktor Heterogenität (DASGIP Scale-Down System)
Anwendung und Anpassung von automatisierten Assays zur Produktquantifizierung (Opentrons und TECAN-Robotikplatform)
Selbstständige Datenauswertung und Präsentation der Ergebnisse
Sorgfältige Dokumentation der durchgeführten Arbeiten

Ihr Profil:

Sie studieren Biologie, Biotechnologie, Bioverfahrenstechnik oder eine verwandte Disziplin im Master
Interesse an mikrobieller Kultivierung im Labormaßstab, Robotik, Programmieren und Laborautomatisierung
Bereitschaft sich in neue Methoden und einfache Programmierung mit Python einzuarbeiten
Hohes Maß an Selbstständigkeit, Motivation und Zuverlässigkeit

Unser Angebot:
Wir arbeiten an hochaktuellen, innovativen Themen und bieten Ihnen die Möglichkeit, den Wandel aktiv mitzugestalten! Wir bieten Ihnen:

Ein interessantes und gesellschaftlich relevantes Thema für ihre Abschlussarbeit mit zukunftsorientierter Themenstellung
Eine exzellente wissenschaftliche Ausstattung und die neuste Technologie
Qualifizierte und gewissenhafte Betreuung durch wissenschaftliche Kolleg:innen
Interdisziplinäre Zusammenarbeit in einem engagierten und kollegialen Team

Neben spannenden Aufgaben und einem kollegialen Miteinander bieten wir Ihnen noch viel mehr: https://go.fzj.de/Benefits

Wir freuen uns über Bewerbungen von Menschen mit vielfältigen Hintergründen, z.B. hinsichtlich Alter, Geschlecht, Behinderung, sexueller Orientierung / Identität sowie sozialer, ethnischer und religiöser Herkunft. Ein chancengerechtes, diverses und inklusives Arbeitsumfeld, in dem alle ihre Potentiale verwirklichen können, ist uns wichtig.