CIS består af i alt fire teams, der arbejder tæt sammen
- EUI-teamet forestår minister- og direktionsbetjening på EU- og internationale sager på veterinær- og fødevareområdet, styrelsens indsats for bedre EU-regulering og varetagelse af danske interesser i EU og internationalt.
- SSC-teamet arbejder primært med eksportfremme, myndighedssamarbejde med 3. lande bl.a. gennem otte SSC-projekter (Strategic Sector Cooperation)
- Forkontoret assisterer resten af enheden både administrativt og praktisk. Teamet består af to erfarne kontorfunktionærer samt to studentermedhjælpere.
- Intern audit-teamet som varetager audit af Fødevarestyrelsens kontrolsystemer.
EUI-teamets arbejde tager udgangspunkt i Fødevarestyrelsens Internationale Strategi 2024-2027 og Strategi for Fødevarestyrelsens EU-arbejde 2023-2026. Formålet med strategierne er at sikre, at styrelsens faglige viden effektivt bringes i spil på den internationale scene og i EU, samt at danske løsninger kan være med til at lede den grønne omstilling og bidrage til en mere bæredygtig fremtid.